Через территорию края проходят трассы крупнейших нефтепроводов: АО "Черноморские магистральные нефтепроводы" и ЗАО "Каспийский трубопроводный консорциум-Р" (КТК-Р). Введение в действие системы КТК стало важным событием не только для края, но и для России в целом, по ней ежегодно планируется перекачивать 28 млн.тонн нефти, а в будущем увеличить объем до 67 млн. тонн.

Трассы крупнейших магистральных газопроводов ООО "Кубаньгазпром" также проходят по территории края. В декабре 2003 года введена в эксплуатацию вторая очередь газопровода Россия-Турция "Голубой поток". Общая протяженность газопровода 1213 км, из которых 317 км пройдут по территории Краснодарского края. К 2008 году газопровод будет работать на полную проектную мощность – объем поставок достигнет 16 млрд. кубометров газа в год. Ведется разработка новых проектов.