Прибайкальский национальный парк образован в 1986 году. Общая площадь парка составляет 418 тыс. га. По охраняемой площади он входит в пятерку крупнейших национальных парков России. Территория парка охватывает западное побережье Байкала от его южной оконечности до малого моря, включая остров Ольхон. Протяженность береговой линии парка составляет почти 380 км. Ширина охранной береговой зоны от 8 до 30 км. Более 300 тыс. га (70% территории парка) занимают леса, из них 22 тыс. га – кедрачи. На территории Прибайкальского национального парка находится более 500 видов растений и животных, половина из которых эндемики. В парке насчитывается 75 видов животных, некоторые из них занесены в «Красную книгу», 76 редких и находящихся под охраной растений. По подсчету в 1994 году на территории парка численность изюбра составила 914 особей, косули – 707, лося – 67, кабана – 87, бурого медведя – 140. на территории парка 52 географических объекта имеют статус природных памятников.

Забайкальский национальный парк. Территория парка, организованного в 1986 году, охватывает Чевыркуйский залив, полуостров Святой нос, архипелаг Ушканьи острова с крупнейшим на Байкале лежбищем нерпа. Площадь парка – 270 тыс. га. 40% территории парка имеет заповедный режим, здесь запрещена всякая хозяйственная и рекреационная деятельность. По парку проложено 5 пеших туристских маршрутов, среди которых выделяется маршрут на гору Марково, наивысшую горную вершину полуострова Святой Нос, откуда открывается круговая панорама на Ушканьи острова, северную часть Чевыркуйского залива и песчаные пляжи Баргузинского залива. На территории парка насчитывается 291 вид животных, 3 вида земноводных и 3 вида пресмыкающих. Птицы представлены 241 видом, среди них такие редкие, как сапсан, черный журавль, беркут, черный аист, орлан-долгохвост, орлан-белохвост и др.

Тункинский национальный парк учрежден 27 мая 1991 года в административных границах Тункинского района. Территория парка занимает Тункинскую долину и прилегающие к ней горные массивы Восточного саяна и хребта Хамар-Дабан. В России это первый опыт совмещения природоохранной зоны с границами целого района. Площадь парка 1 183 662 га (из них 150 836 га земель заняты под сельскохозяйственные угодья). Территория парка хорошо освоена. Большая часть Тункинской долины занята пашнями, сенокосами и пастбищами. Население района 29 000 человек. По парку проходит автомобильная дорога в Монголию. В долине расположены крупные курорты: «Аршан», «Нилова пустынь», «Жемчуг». На территории парка можно встретить разнообразные виды редких и исчезающих растений: пион марьин корень, красоднев малый, лютик саянский, облепиха крушиновская, родиола розовая, маннагеттея Гуммеля и др.

Байкальский заповедник расположен на восточном берегу в южной части Байкала и охватывает территорию в 165,7 тыс. га горного массива Хамар-Дабан. Границы заповедника проходят по рекам Мишиха и Выдринная. Организован в 1969 году. Научный профиль заповедника – изучение природного горно-таежного комплекса хребта – Хамар-Дабан на побережье озера Байкал. Хамар-Дабан представляет собой систему горных массивов с округлыми формами вершин без резко выраженного гребня. Горы круто обрываются к Байкалу и являются преградой для воздушных потоков, переносимых черех Байкал, что сопровождается интенсивным выделением осадков, которых здесь выпадает больше, чем на смежных пространствах Сибири. Влажный климат способствует богатому разнообразию горно-таежной растительности. На территории заповедника выявлены реликтовые формы неогенового периода (тополь душистый, анемона байкальская), эндемики (мятник иркутский, шибатерантис сибирский и др.), а также редкие и находящиеся на грани исчезновения животные и растения. В заповеднике известны 37 видов млекопитающих и 260 видов птиц.